摘要：研究人員開(kāi)展了 RARE-seq方法的優(yōu)化研究。
敏感的游離 RNA（cfRNA）檢測(cè)方法有助于進(jìn)行非侵入性基因表達(dá)分析和疾病監(jiān)測(cè)。
這里介紹了 RARE-seq（隨機(jī)引物和 cfRNA 片段親和捕獲測(cè)序富集分析），這是一種針對(duì) cfRNA 分析優(yōu)化的方法。研究表明血小板污染會(huì)嚴(yán)重干擾 cfRNA 分析，并開(kāi)發(fā)出克服該問(wèn)題的方法。在分析驗(yàn)證中，發(fā)現(xiàn) RARE-seq 檢測(cè)腫瘤來(lái)源的 cfRNA 的靈敏度比全轉(zhuǎn)錄組 RNA 測(cè)序（RNA-seq）高約 50 倍，檢測(cè)限為 0.05%。
圖1 一種超靈敏的無(wú)細(xì)胞RNA檢測(cè)方法為探究臨床實(shí)用性，研究人員對(duì) 369 名癌癥患者、非惡性疾病患者和對(duì)照組的 437 份血漿樣本進(jìn)行分析。結(jié)果顯示，在 cfRNA 中檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌表達(dá)特征的靈敏度隨疾病分期增加（I 期 20 例中有 6 例（30%）；II 期 8 例中有 5 例（63%）；III 期 15 例中有 10 例（67%）；IV 期 96 例中有 80 例（靈敏度 83%，特異性 95%）），且 RARE-seq 比基于腫瘤未知的循環(huán)腫瘤 DNA（ctDNA）分析更靈敏。在對(duì)酪氨酸激酶抑制劑產(chǎn)生耐藥性的 EGFR 突變非小細(xì)胞肺癌患者中，檢測(cè)到了組織學(xué)轉(zhuǎn)化和基于突變的耐藥機(jī)制。
圖2 血液采集和cfRNA提取的優(yōu)化
最后，研究還證明了 RARE-seq 在確定腫瘤起源組織、評(píng)估良性肺部疾病和追蹤 mRNA 疫苗反應(yīng)方面的潛在用途。這些結(jié)果突出了超靈敏 cfRNA 分析的潛在價(jià)值，并為多種臨床應(yīng)用提供了概念驗(yàn)證。
參考資料
[1] An ultrasensitive method for detection of cell-free RNA
摘要：研究人員開(kāi)展了 RARE-seq方法的優(yōu)化研究。
敏感的游離 RNA（cfRNA）檢測(cè)方法有助于進(jìn)行非侵入性基因表達(dá)分析和疾病監(jiān)測(cè)。
這里介紹了 RARE-seq（隨機(jī)引物和 cfRNA 片段親和捕獲測(cè)序富集分析），這是一種針對(duì) cfRNA 分析優(yōu)化的方法。研究表明血小板污染會(huì)嚴(yán)重干擾 cfRNA 分析，并開(kāi)發(fā)出克服該問(wèn)題的方法。在分析驗(yàn)證中，發(fā)現(xiàn) RARE-seq 檢測(cè)腫瘤來(lái)源的 cfRNA 的靈敏度比全轉(zhuǎn)錄組 RNA 測(cè)序（RNA-seq）高約 50 倍，檢測(cè)限為 0.05%。
圖1 一種超靈敏的無(wú)細(xì)胞RNA檢測(cè)方法為探究臨床實(shí)用性，研究人員對(duì) 369 名癌癥患者、非惡性疾病患者和對(duì)照組的 437 份血漿樣本進(jìn)行分析。結(jié)果顯示，在 cfRNA 中檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌表達(dá)特征的靈敏度隨疾病分期增加（I 期 20 例中有 6 例（30%）；II 期 8 例中有 5 例（63%）；III 期 15 例中有 10 例（67%）；IV 期 96 例中有 80 例（靈敏度 83%，特異性 95%）），且 RARE-seq 比基于腫瘤未知的循環(huán)腫瘤 DNA（ctDNA）分析更靈敏。在對(duì)酪氨酸激酶抑制劑產(chǎn)生耐藥性的 EGFR 突變非小細(xì)胞肺癌患者中，檢測(cè)到了組織學(xué)轉(zhuǎn)化和基于突變的耐藥機(jī)制。
圖2 血液采集和cfRNA提取的優(yōu)化
最后，研究還證明了 RARE-seq 在確定腫瘤起源組織、評(píng)估良性肺部疾病和追蹤 mRNA 疫苗反應(yīng)方面的潛在用途。這些結(jié)果突出了超靈敏 cfRNA 分析的潛在價(jià)值，并為多種臨床應(yīng)用提供了概念驗(yàn)證。
參考資料
[1] An ultrasensitive method for detection of cell-free RNA
